不知道你们那边的二手房交易是什么程序，那我可以给你提供一下江苏苏州和昆山两个地方遇到这种情况下的处理方法，希望可以对你有帮助！
江苏苏州，现在是要进行资金托管的，那么你的首付款就会全部的进入交易中心的金融中心，那么就没有多余的金额给卖出方去还贷款了。这时候要么就是按照合同上的违约事项（如果房东签约前，有承诺交易中不会他不会出现问题）来给你进行赔款。或者和中介公司进行协商，让中介垫支，然后到后面你的尾款（或着是贷款）金额里面扣除垫款部分（当然可能中介公司要收部分钱做利息）；
那么江苏昆山，现在还是二手房款经过中介公司的，你的手首付款就可以拿去还房东那边的贷款了，那这样就可以等房东还完贷款后正常的进行过户手续了。
具体情况你可以咨询你当地的房产交易中心，他们会告诉你想要的答案的。