看了你的问题，我想把我实践中的处理方法提供给你做参考。

首先，我肯定你的项目经理的处理方法是正确的。因为，为安装钢化玻璃而定制软垫，一定会非常适合现场的情况，从而使安装的可靠性毋庸置疑。
其次，在保证安全可靠的前提下，是能够拿出更加简单而成本低廉的处理措施。
我不知道你的钢化玻璃的具体情况，但我估计是安装地面(如果是墙面可以不用软垫或仅在固定处用小橡胶圈垫即可)，所以，项目经理才非常慎重地提出定制软垫。不用定制软垫，但按照缓冲和坚固的道理，可以用橡胶垫条来替代定制软垫，实现玻璃与地面其它材质的结合。这个橡胶垫条可以用普通的汽车内胎裁剪而成，厚度根据需要而决定是用两层或一层。这种材料就非常便宜而且很容易找到。

不过，用汽车内胎作的橡胶垫条都是黑色的，在玻璃下把难看的黑色暴露无遗是不爽的事。解决的办法是用油漆把黑色橡胶条涂刷成你需要的颜色(只需刷一面)。

希望我的回答能够对你有所帮助。