根据中国预防医学科学院消毒研究中心测试的数据表明：消毒柜内部的温度必须达到125℃，而且持续保持10分钟，才能把对人身体有害的牙孢菌及肝炎病菌杀死。出于这个原因，只有单一远红外线消毒功能的消毒柜中不宜存放塑料器皿，因为要想在柜内达到125℃，不论是采用石英管还是电热丝发热，发热元件附近的温度肯定会大大高于125℃，塑料容器在长时间的烘烤之下，很容易变形，同样的原因，消毒柜消毒过的器皿也不能马上取出来，以免高温伤手。不过，有些高档双门产品还附加有臭氧杀菌功能，用上层的低温消毒室专门对那些不耐高温的餐具进行消毒。其原理是利用高压无声放电装置产生臭氧分子，通过臭氧分子还原成氧分子所产生的强氧化作用来实现杀菌目的。
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