食品安全是当前公众最为关怀的问题之一，虽然我国已采取多项措施加强了对食品安全的监管，但食品安全事件仍时有发生。现实上，在问题的背后，除了监管体系依然不够完善、少数不法厂商见利忘义等原因外，很可能还由于食品行业中存在一些深层次的矛盾尚未得到解决，从而使安全监管的难度加大。
食品安全问题中第一个深层次矛盾是质量安全和数量安全的关系。笔者认为，食品的数量安全和质量安全在肯定程度上存在着矛盾，即提高食品的质量往往要以降低产量为代价。农业消费技术以及食品加工技术的进步，大大提高了食品消费的效率并降低了消费成本。但是，食品消费技术的进步是一柄双刃剑，若控制不当就会带来质量安全问题。例如，种植业中滥用化肥和农药，养殖业中滥用激素和抗生素，以及食品加工过程中运用各种有害的添加剂，等等。“三聚氰胺奶粉事件”也从侧面说明，食品行业中消费扩张过快，很可能会威胁质量安全。因此，如果要同时提高食品的质量和产量，则必须在技术体系层面对食品消费进行彻底的改进，而这需要通过加大对农业和食品产业的投入才能完成。
食品安全问题中第二个深层次矛盾是食品质量与食品价格的关系。长期以来，我国的食品价格稳定在一个较低的水平，虽然总体上对消费者是有利的，但也可能带来食品质量低劣的问题，最终损害消费者的权益。
就如何改善食品质量，人们已提出了大量的建议，但一般都忽视了改善食品质量所产生的成本问题，仍希望在提高食品质量的同时保持低价格。但当价格低到肯定程度时，食品消费者可能会陷入“遵循了质量标准就要亏损”的困局，现实上这正是一些厂商消费劣质食品以至不惜掺入有害物质的初始动因。务实地来看，伴着食品质量的改善，其消费成本的提高是不可避免的，因此有必要在合理的范围内答应提高食品的价格水平，同时，也需相应地提高人们的收入水平和消费能力。
此外，我国的食品安全还面临着一些其他矛盾。我国的食品消费者特别分散，不利于建立完备的质量安全体系；在食品安全事件发生后，处罚问题厂商和保护产业发展之间可能会出现两难；少数企业在对待食品质量时存在“重出口，轻内销”的心态，等等。要从根本上改善我国的食品质量，就应重视并解决这些深层次的矛盾。
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